Sao Tome og Principe er ríki á miðbaug við Guineaflóa í Mið-Afríku, 1001 km² að flatarmáli.  Þetta eru tvær aðaleyjar og fjöldi smáeyja og hólma.  Sao Tomé-eyja er ávöl í laginu, u.þ.b. 49 km löng og 860 km².  Höfuðborgin Sao Tomé-borg er á norðausturenda eyjarinnar.  Principe-eyja er u.þ.b. 150 km norðaustar.  Hún er mun minni, 16 km löng og 142 km², og strandlengja hennar er mun óreglulegri.  Næsti nágrenni landsins er Gabon og Miðbaugsgínea á Atlantshafsströnd Mið-Afríku.